Connecter des appareils d'analyse, des machines d'essai, des laboratoires externes et des systèmes ERP tels que SAP au LIMS : CSV, JSON, XML, API REST et SFTP — grâce à un mappage assisté par l'IA.
L'appareil imprime ou exporte les données, puis quelqu'un les saisit manuellement dans le système. Chaque valeur est traitée deux fois, et c'est lors de la deuxième saisie que les erreurs de saisie se produisent.
Un appareil génère des points-virgules, le suivant des tabulations, et le troisième ne commence l'en-tête qu'à la ligne 13. Pour chaque format, une solution Excel personnalisée est mise à jour.
En l'absence de référence claire, quelqu'un doit déterminer à quel échantillon correspond une valeur de mesure. Cela fonctionne… jusqu'à ce que cela ne fonctionne plus et que cela soit relevé lors de l'audit.
Une nouvelle interface implique un ticket, un prestataire et un délai d'attente. D'ici là, l'étape intermédiaire continuera à s'effectuer via Excel.
C'est précisément à cela que sert l'éditeur d'interfaces d'importation de la base de données du laboratoire : un outil permettant de connecter les nombreux appareils, systèmes et laboratoires externes, très variés et utilisés à des fréquences différentes — de l’analyseur qui transmet ses résultats toutes les heures au laboratoire partenaire qui envoie un fichier trois fois par an.
L'éditeur d'interface d'importation ne se limite pas aux appareils d'analyse. Les commandes, les données de base et les documents sont également importés via cette même interface.
À cela s'ajoutent les notes, la saisie des temps et les fichiers — soit au total 19 types de données pouvant être créés ou mis à jour via des interfaces d'importation.
Les formats HL7 et LDT permettent l'échange de données médicales. Excel fonctionne également : il suffit de l'enregistrer au format CSV dans Excel. Tout le reste est ajouté via un code de transformation.
Quatre options, du mode manuel au mode entièrement automatisé. Le choix dépend de trois facteurs : les capacités de votre système source, les possibilités offertes par votre infrastructure informatique et la fréquence d'arrivée des données.
Téléverser le fichier d'exportation de l'appareil directement dans l'interface. La solution idéale pour débuter et pour les appareils qui fonctionnent rarement.
L'appareil enregistre le fichier sur le serveur ; la base de données du laboratoire le récupère automatiquement. Les fichiers importés sont déplacés ou supprimés.
Soit le système tiers envoie les données de manière active par POST, soit la base de données du laboratoire les récupère. C'est la méthode la plus rapide — pratiquement en temps réel.
L'interface accepte les pièces jointes par e-mail. Utile pour les laboratoires partenaires qui ne proposent pas d'autre solution.
ChatGPT, Claude et d’autres applications d’IA transmettent des données via des interfaces d’importation ouvertes : le rapport pathologique est dicté plutôt que saisi au clavier, le prélèvement est enregistré à la voix lors des déplacements, et les résultats microbiologiques sont consignés sans avoir à utiliser ses mains.
Vous créez votre propre page HTML ou un formulaire — pour le prélèvement sur site, pour les expéditeurs ou pour un enregistrement qui n'existe pas encore sous cette forme. Une fois envoyées, les données sont directement transférées vers l'interface d'importation.
Lors du mappage, vous déterminez quelle colonne de votre fichier correspond à quel champ de la base de données du laboratoire : client, commande, échantillon, point de prélèvement, paramètre, valeur mesurée.
Vous importez un fichier modèle, la base de données du laboratoire lit la ligne d'attributs, puis vous procédez au mappage. Que les paramètres soient disposés côte à côte dans des colonnes ou les uns en dessous des autres dans des lignes n'a aucune importance : c'est le mappage qui s'adapte à la structure de votre fichier, et non l'inverse.
Chaque attribut se voit attribuer un nom explicite : un en-tête de colonne cryptique devient ainsi « Échantillonneur ».
Si un champ du fichier d'importation est vide, la base de données du laboratoire le remplit automatiquement avec la valeur par défaut enregistrée.
Il est possible de regrouper plusieurs colonnes en un seul champ : le prénom et le nom de famille sont ainsi regroupés en un seul nom.
Un modèle valide les données dès leur importation : si une valeur ne correspond pas au format attendu, l'importation est interrompue, ce qui évite de créer des données erronées.
Un code de transformation génère ensuite le format requis avant que le mappage ne s'applique. Les administrateurs de votre laboratoire peuvent rédiger et mettre à jour ce code eux-mêmes. Nous pouvons également nous en charger dans le cadre d'un service facturé à l'heure. Dans la fenêtre d'importation, vous verrez alors les deux éléments côte à côte : les données brutes et la version convertie.
Code de transformation dans le manuelProtocoles de prélèvement manuscrits, photos de résultats de mesure, fichiers PDF provenant de clients ou de laboratoires tiers : l’extension IA convertit les documents non structurés en données structurées, les vérifie et les transfère vers l’importation.
Un modèle génère un résultat, tandis qu'un second le vérifie de manière indépendante. Les deux propositions sont présentées côte à côte, chacune accompagnée d'un niveau de confiance : vous voyez immédiatement sur quels points elles concordent et sur quels points elles divergent.
Pour chaque champ reconnu, la base de données du laboratoire indique l'emplacement dans le document original d'où provient la valeur. Les éléments qui ne sont pas univoques sont signalés pour vérification manuelle au lieu d'être repris automatiquement.
L'IA est autorisée à effectuer des recherches ciblées dans la base de données — par exemple, pour rechercher l'instrument de contrôle mentionné et l'associer correctement. Elle ne donne pas de conseils, elle effectue simplement des recherches.
Pour savoir en détail comment fonctionne l'extension IA, quels types de données elle reconnaît et comment la configurer pour chaque interface, veuillez consulter la page qui lui est consacrée.
Consulter les importations basées sur l'IAUne importation peut créer, mettre à jour ou ne rien modifier délibérément. Le mode est défini pour chaque interface — et s'applique alors à chaque exécution.
Le mode par défaut est update : la nouvelle valeur est toujours prise en compte. Il existe également des modes qui ne remplissent que les paramètres vides, ne mettent à jour que ceux qui existent déjà, créent les paramètres manquants sans leur attribuer de valeur, ou ajoutent les valeurs mesurées à une série de chiffres existante. Si vous ne souhaitez pas écraser de données lors d'une nouvelle mesure, choisissez un mode « ignore » — avec ou sans avertissement.
Tous les modes d'importation dans le manuel
Chaque interface est d'abord configurée à cet endroit et testée à l'aide de fichiers d'exemple anonymisés. Elle n'est mise en production qu'après validation réussie.
Un simple clic permet de tester le SFTP ou le FTP : accessibilité, identifiants de connexion et droits d'écriture. L'interface HTTPS renvoie un code 200 ou 400 avant que les données réelles ne soient transmises.
Champs obligatoires manquants, identifiants inconnus, caractères spéciaux, valeurs vides : tout ce qui peut mal tourner au quotidien doit être pris en compte dans les tests — et non lors de la première mise en production.
Chaque cycle d'importation est consigné et peut être répété. En cas d'erreurs, vous pouvez identifier à quel niveau le problème se situe : fichier source, clé, mappage ou transformation.
Et tout ce qui ne figure pas ici est ajouté grâce au mappage et à la transformation — le format de l'appareil ne fait que déterminer l'ampleur du travail préparatoire nécessaire.
Chaque étape est documentée — à l'aide de captures d'écran, de fichiers d'exemple et de vidéos. Accès libre, même avant de prendre une décision.
Étapes détaillées avec vidéo : Importer des données de mesure. Pour aller plus loin : Aperçu des interfaces d’importation, Créer une interface d’importation de données de mesure au format CSV, Importer les résultats des appareils de mesure, Code de transformation pour d’autres formats de données, Importation automatique via FTP/SFTP et Extension IA des interfaces d'importation.
Système de gestion des informations de laboratoire (LIMS)
Faciliter la documentation et respecter au quotidien les exigences ISO