将分析仪器、测试机、外部实验室以及SAP等ERP系统与LIMS对接:支持CSV、JSON、XML、REST-API和SFTP——采用基于人工智能的映射技术。
设备打印或导出数据后,有人会手动将数字录入系统。每个数值都要经过两次处理,而在第二次处理时就会出现数字颠倒的情况。
一个设备输出分号,下一个输出制表符,第三个则要到第13行才开始显示标题行。针对每种格式,都需要维护一个专门的Excel临时解决方案。
如果没有明确的键,就必须由某人来决定某个测量值属于哪个样本。这种做法通常可行——直到某次行不通,并在审计中被发现为止。
新增一个接口意味着需要开一张工单、联系一家服务商以及等待时间。在此之前,这一步骤仍将通过Excel继续处理。
LDB LIMS的导入接口编辑器正是为此而设计的: 这是一个可将众多类型各异、使用频率不一的设备、系统和外部实验室接入系统的工具——从每小时提交数据的分析仪,到每年发送三次文件的合作伙伴实验室,均可实现对接。
导入接口编辑器不仅限于分析仪器。任务、主数据和文档也是通过同一界面导入的。
此外还有笔记、工时记录和文件——共计19种数据类型,均可通过导入接口进行创建或更新。
HL7 和 LDT 支持医疗数据交换。Excel 同样适用——只需在 Excel 中将其保存为 CSV 文件即可。其他内容则通过转换代码添加。
从手动操作到全自动操作,共有四种方式。选择取决于三个因素:源系统的功能、IT系统的支持程度以及数据更新的频率。
将设备的导出文件直接上传至接口。这是一种入门方式,也适用于运行频率较低的设备。
该设备将文件存储在服务器上,LDB LIMS会自动调用该文件。导入的文件将被移动或删除。
外部系统会主动通过POST方法发送数据,或者由LDB LIMS主动获取数据。这是最快捷的方式——几乎是实时的。
该接口可通过电子邮件接收附件。对于仅提供此种方式的合作伙伴实验室而言,这非常有用。
ChatGPT、Claude 及其他人工智能应用程序通过开放的导入接口传输数据——病理学诊断报告通过语音录入而非手动输入,采样过程可在移动中通过语音记录,微生物学检测结果则可解放双手进行记录。
您可以自行创建一个HTML页面或表单——用于现场采样、供提交者使用,或是用于目前尚未存在的数据采集。提交后,输入的数据将直接进入导入接口。
在映射过程中,您需要指定文件的哪一列对应LDB LIMS中的哪个字段:客户、订单、样本、采样点、参数、测量值。
您上传一个示例文件,LDB LIMS会读取其中的属性行,然后您进行映射。无论参数是并排排列在列中,还是逐行排列,都无关紧要——映射会遵循您文件的结构,而不是相反。
每个属性都会被赋予一个通俗易懂的名称——原本晦涩难懂的列标题变成了“取样器”。
如果导入文件中的某个字段为空,LDB LIMS会自动将其填充为预设的默认值。
可以将多个列合并为一个字段——名字和姓氏合并为“姓名”。
一个模板会在导入时对数据进行验证:如果某个值不符合预期格式,导入过程会立即中止,而不是生成无效数据。
随后,在映射生效之前,转换代码会生成所需的格式。您实验室的管理员可以自行编写和维护该代码。此外,我们也可提供此项服务,按小时计费。在导入窗口中,您将看到原始数据和转换后的版本并排显示。
手册中的转换代码手写采样记录、拍摄的测量结果照片、来自委托方或外部实验室的PDF文件:该AI扩展功能可将非结构化文档转换为结构化数据,对其进行验证,并将其传递至导入环节。
一个模型进行预测,另一个模型则独立验证结果。两个建议并列显示,各自附有置信度值——您可以立即看出它们在哪些方面一致、哪些方面不一致。
对于每个被识别的字段,LDB LIMS都会显示该值在原始文档中的来源位置。对于无法明确识别的内容,系统会将其标记为需人工核查,而非默认直接采用。
人工智能可以有针对性地在数据库中进行检索——例如查找上述检测设备并准确匹配。它不提供建议,只是进行检索。
关于该 AI 扩展功能的具体工作原理、可识别的数据类型以及如何针对每个接口进行配置,请参阅其专属页面。
查看基于AI的进口商品导入操作可以创建、更新数据,也可以选择不进行任何操作。该模式需针对每个接口分别设置——并适用于每次运行。
默认模式为 update:新值将无条件被采用。此外,还有其他模式:仅填充空参数、仅更新已存在的参数、为缺失的参数创建无值的条目,或将测量值追加到现有的数值序列中。 如果不想在重复测量时覆盖原有数据,可选择“忽略”模式——该模式可选择是否显示警告。
手册中的所有导入模式
每个接口首先会在该处进行配置,并使用匿名化的示例文件进行测试。只有在验证成功后,该接口才会投入生产环境。
只需点击一下即可测试 SFTP 或 FTP:可达性、登录凭据和写入权限。在实际数据传输之前,HTTPS 接口会返回 200 或 400 状态码。
缺失的必填字段、未知ID、特殊字符、空值:日常使用中可能出现的问题,都应纳入测试——而不是留到首次正式运行时才发现。
每次导入操作都会被记录,并且可以重复执行。如果出现错误,您可以查看问题出在哪个环节——源文件、密钥、映射还是转换。
而这里未提及的所有内容,都可以通过映射和转换来实现——设备格式仅决定了需要多少前期准备工作。
每个步骤都有详细记录——包括截图、示例文件和视频。可自由访问,即使在做出决定之前也是如此。
附带视频的分步指南:导入测量数据。 延伸阅读:导入接口概览、创建CSV测量数据导入接口、 导入测量仪器的结果、其他数据格式的转换代码、 自动FTP/SFTP导入以及导入接口的AI扩展。