Alternatives au LIMS : quelles options pour les laboratoires et quand changer de solution ?

Konrad Wagner
Konrad Wagner
02/10/2024
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Le défi de trouver une alternative au LIMS adaptée à son laboratoire

Introduction : Un LIMS (système de gestion de l’information de laboratoire) est un outil indispensable pour de nombreux laboratoires modernes. Pourtant, il ne constitue pas toujours la meilleure solution ni la plus économique. Quelles alternatives existent et quels sont leurs avantages et leurs limites ? Cet article présente les principales alternatives au LIMS, avec les éclairages pratiques et les recommandations de Konrad M. Wagner, directeur de Labordatenbank à Berlin.

Les principales alternatives au LIMS

Systèmes ERP, CAQ et CRM : des solutions existantes comme alternatives au LIMS

De nombreuses grandes entreprises utilisent leurs systèmes ERP existants, tels que SAP ou Microsoft Dynamics, pour intégrer les processus de laboratoire. Mais, comme l’explique Konrad M. Wagner, ces systèmes répondent rarement de manière idéale aux besoins spécifiques d’un laboratoire : « Un ERP n’est souvent pas conçu pour les exigences du laboratoire. Les fonctions spécialisées, comme la gestion des échantillons ou l’étalonnage des instruments, nécessitent des adaptations complexes et coûteuses. » Un autre problème tient au fait que ces systèmes sont souvent déployés à l’échelle de l’entreprise avant que le laboratoire puisse les utiliser. « Le laboratoire a généralement peu d’influence sur la configuration et ses besoins particuliers sont souvent négligés », précise Wagner.

Les anciens systèmes : une alternative au LIMS souvent problématique

De nombreux laboratoires utilisent encore d’anciens LIMS sur mesure, développés spécialement pour leur laboratoire ou leur secteur. Ces systèmes ont généralement été adaptés précisément à leurs besoins, mais l’avenir des mises à jour et surtout du support reste incertain ; certaines dates de fin de support ont même déjà été annoncées. Par exemple, le support du VUP LIMS prendra fin en 2033. « Les fonctionnalités modernes, comme les signatures numériques, les interfaces ou les factures au format XRechnung, font souvent défaut et leur ajout n’est tout simplement plus possible », explique Wagner. Un point particulièrement critique est que les anciens systèmes ne répondent souvent pas aux exigences de qualité actuelles, notamment celles de la norme ISO 17025. Wagner souligne : « Les pistes d’audit et la conservation des enregistrements à l’abri des modifications manquent souvent ou ne couvrent que certains domaines, ce qui complique le respect des exigences d’accréditation. »

Les applications courantes : Excel, Access et autres

Excel et les bases de données Access sont souvent considérés comme des alternatives économiques et flexibles au LIMS. Pourtant, comme le souligne Wagner, cette flexibilité représente souvent un risque pour la sécurité. « Excel n’offre pas de protection efficace contre les modifications involontaires et ne convient donc pas aux laboratoires exigeant une sécurité élevée des données. » Access apporte davantage de structure, mais présente aussi de sérieuses limites : « Access se prête peu à l’automatisation des processus de laboratoire et ne dispose pas de fonctions essentielles d’assurance qualité, telles que les pistes d’audit. » Des logiciels de gestion de projet comme Trello ou Jira sont également parfois détournés de leur usage, sans proposer de fonctions spécialisées pour le laboratoire. « Ces logiciels ne conviennent pas aux tâches complexes, comme le suivi des échantillons ou l’intégration des instruments », avertit Wagner.

Les alternatives inhabituelles au LIMS et leurs limites

Outre les solutions classiques, certaines alternatives inhabituelles au LIMS reposent sur des outils de communication comme Teams ou Outlook, ou sur de simples arborescences de dossiers sur des serveurs locaux. « Ces outils conviennent à la gestion des tâches, mais pas à celle des processus de laboratoire », précise Wagner. Ils ne disposent pas non plus des mécanismes de protection nécessaires aux audits. « Sans fonctions telles que les pistes d’audit ou la conservation des enregistrements à l’abri des modifications, il devient presque impossible de satisfaire aux normes d’accréditation », ajoute-t-il.

Quand le choix d’une alternative au LIMS est-il pertinent ?

Wagner souligne qu’une alternative au LIMS peut être pertinente uniquement dans des cas très particuliers : « Pour des domaines très spécialisés, comme les biobanques, il existe des outils plus simples et moins coûteux qu’un LIMS complet. » Les laboratoires doivent toutefois analyser précisément leurs exigences avant de choisir une alternative. « Il est important de vérifier que l’alternative au LIMS couvre réellement la majorité des processus », conseille Wagner.

Les points à vérifier lors du choix d’une alternative au LIMS

Les laboratoires qui choisissent une alternative au LIMS doivent examiner plusieurs points importants. Wagner recommande : « Une bonne alternative au LIMS doit être aussi flexible que possible, notamment pour la présentation et la maintenance de documents personnalisés tels que les rapports d’essai. » La pérennité de l’investissement joue aussi un rôle essentiel : « Assurez-vous que le système bénéficiera d’un support à long terme et qu’il ne nécessitera pas d’évolutions coûteuses pour rester à jour. »

Bien préparer le choix de la meilleure alternative au LIMS

« Une bonne préparation est déterminante », explique Wagner. Il recommande de constituer une petite équipe réunissant la direction du laboratoire, le responsable qualité et un spécialiste informatique. « Il faut définir clairement les besoins du laboratoire et tester les systèmes en profondeur, notamment leurs possibilités de configuration », poursuit-il. C’est la condition pour prendre une décision éclairée.

Résumé
Les alternatives au LIMS peuvent convenir à certains laboratoires, mais elles offrent rarement toutes les fonctionnalités d’un LIMS spécialisé. Beaucoup atteignent leurs limites en matière d’assurance qualité, de conformité à l’ISO 17025 ou d’automatisation des processus. Konrad M. Wagner recommande de toujours tenir compte des exigences propres au laboratoire et de s’assurer de la disponibilité d’un support à long terme. Wagner et Labordatenbank proposent des entretiens initiaux et d’analyse gratuits pour aider les laboratoires à choisir la meilleure solution.

L’alternative la plus courante au LIMS : continuer comme avant

Alternatives au LIMS : aperçu des avantages et des limites

De nombreuses grandes entreprises disposent déjà de systèmes complets pour leur secteur, couvrant différents processus métier, dont certains aspects du fonctionnement du laboratoire.

  • Systèmes ERP (par exemple SAP, Microsoft Dynamics)
    • Leur rôle central dans l’entreprise permet d’intégrer de nombreux processus : gestion des clients, production — y compris achats et approbations — ainsi que gestion des équipements de contrôle et des matériaux.
    • Limites : la gestion des échantillons, l’intégration des instruments ou les contrôles qualité internes au laboratoire nécessitent souvent des adaptations complexes et coûteuses. Ces systèmes ne sont pas conçus à l’origine pour les exigences particulières des laboratoires.
  • Systèmes d’information hospitaliers (par exemple Medico, Orbis, M-KIS)
    • Avantages : les différents services et sites hospitaliers, y compris les laboratoires, peuvent échanger les données médicales des patients.
    • Limites : ils sont souvent conçus pour l’échange de données et l’administration plutôt que pour les besoins propres au laboratoire.
  • Systèmes CRM (par exemple Salesforce, Microsoft Dynamics CRM)
    • Avantages : ils gèrent les relations clients et les demandes externes. Ils peuvent être utiles aux laboratoires prestataires fortement orientés vers leurs clients et y restent souvent utilisés en complément.
    • Limites : malgré cette proximité avec les clients, ils ne proposent pas de fonctions intégrées de gestion des échantillons, comme la gestion des points de prélèvement. Ils ne prennent pas en charge les prestations du laboratoire au moyen de listes de travail ou de rapports et ne peuvent pas être adaptés aux laboratoires.
  • Systèmes CAQ (gestion de la qualité assistée par ordinateur)
    • Avantage : ils se concentrent sur la gestion de la qualité et la conformité, ce qui peut être utile aux laboratoires en environnement réglementé.
    • Limite : ils ne sont pas optimisés pour l’ensemble du flux de travail d’un laboratoire et conviennent particulièrement mal aux processus de recherche et développement.

À savoir : ces systèmes doivent être déployés dans toute l’entreprise avant de pouvoir être utilisés par le laboratoire. D’expérience, l’ERP est rarement mis en place d’abord au laboratoire, qui a souvent peu de poids dans sa configuration et son adaptation à ses besoins. Faute de priorité, les laboratoires doivent accepter des compromis peu efficaces qui ne couvrent que certains domaines. Les exigences fondamentales d’accréditation, telles qu’une traçabilité complète dans la piste d’audit, la protection des enregistrements contre les modifications et la documentation qualité, ne peuvent donc pas être couvertes.

De nombreux laboratoires ont développé pendant des années leurs propres solutions sur mesure avec un développeur interne ou un prestataire externe dédié. Ces systèmes répondaient à leurs besoins particuliers, mais finissent par atteindre leurs limites en matière de support et d’évolution lorsque le développeur part à la retraite ou que l’environnement de développement n’est plus compatible avec les nouvelles versions de Windows.

  • Anciens systèmes personnalisés
    • Avantages : ils sont étroitement adaptés aux exigences du laboratoire et proposent souvent des fonctions et des écrans détaillés pour le travail quotidien, d’où une forte adhésion des utilisateurs.
    • Limites : technologie dépassée, impossibilité d’ajouter de nouvelles fonctions, dépendance au départ de personnes clés comme le développeur, absence de support et failles de sécurité. Les nouvelles normes, telles que les interfaces nationales SHAPTH ou la facturation électronique, ne peuvent plus être intégrées avec un effort raisonnable. Ces systèmes développés sur de longues années n’offrent souvent pas les fonctions modernes désormais considérées comme standard par les utilisateurs. Elles sont absentes ou ne peuvent être intégrées qu’au prix d’efforts et de coûts importants.

À savoir : les anciens systèmes ont souvent été développés sans fonctions prenant en charge les processus de gestion de la qualité de la version actuelle de l’ISO 17025. Il faut alors fréquemment recourir à d’autres systèmes ou au papier.

  • Excel, macros et systèmes de fichiers développés en interne
    • Simples d’utilisation et largement répandus, ils constituent souvent le premier outil pour recueillir les résultats, les importer depuis les instruments et les analyser.
    • Travail manuel important, risque d’erreurs, automatisation limitée, absence de fonctions assurant l’intégrité des données et la conformité. Sécurité faible. Pas de droits d’accès différenciés ni de rôles. Difficultés lorsque plusieurs personnes doivent accéder simultanément au même enregistrement.

Commentaire : Excel est largement utilisé comme outil flexible dans les laboratoires, mais présente d’importantes faiblesses en matière de sécurité et d’intégrité des données. L’absence de protection des accès permet à tout utilisateur de modifier ou supprimer facilement des données, volontairement ou non. Excel ne protège pas non plus contre les modifications involontaires des données. Le risque de perte totale est particulièrement critique : sans sauvegardes suffisantes, les fichiers Excel peuvent être endommagés ou supprimés par erreur. Excel pose donc problème lors des audits des laboratoires soumis à des exigences d’accréditation telles que les pistes d’audit et la protection des enregistrements contre les modifications.

Ces outils ont été conçus pour d’autres tâches, mais sont souvent utilisés dans les laboratoires en raison de leur accessibilité et de leur flexibilité.

  • Logiciels de gestion de projet
    • Adaptés à la gestion des projets de laboratoire et au suivi des tâches.
    • Aucune gestion intégrée des échantillons ou des instruments, ni fonctions propres au laboratoire.
  • Access et bases de données
    • Plus structurés qu’Excel et facilement adaptables à certaines exigences du laboratoire.
    • Les adaptations nécessitent des connaissances techniques ; absence d’automatisation et d’outils spécialisés pour le laboratoire.

En l’absence de LIMS spécialisé, certains laboratoires adoptent des solutions inhabituelles pour gérer leurs activités quotidiennes.

  • Teams, Lotus Notes, Outlook et rappels
    • Avantages : outils facilement accessibles et déjà utilisés dans l’entreprise. Teams et Outlook proposent des fonctions simples de communication et de gestion des tâches.
    • Limites : aucune gestion intégrée des échantillons ni intégration des instruments de laboratoire. Ces outils ne sont pas conçus pour les processus de laboratoire, ce qui limite l’efficacité et la traçabilité.
  • Arborescences de dossiers avec modèles sur des serveurs locaux
    • Avantages : organisation claire, utilisation simple et intégration possible à l’infrastructure informatique existante.
    • Limites : difficultés de montée en charge, maintenance manuelle nécessaire, risques pour la sécurité et la conformité.
  • Bases de données d’instruments de mesure avec rappels
    • Avantages : utiles pour gérer les instruments et équipements de contrôle, avec rappels des opérations de maintenance ou d’étalonnage.
    • Limites : pas d’intégration complète des processus de laboratoire ; couverture limitée à certains instruments ou mesures.

Mon avis : ces outils ne prennent pas en charge les pistes d’audit, la protection des enregistrements contre les modifications ni la traçabilité des changements, indispensables à une gestion de la qualité conforme, par exemple, à l’ISO 17025. Une documentation des processus de laboratoire conforme aux normes est difficilement réalisable.

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